由于作战地区多山，乱民也没有后金那么强的战斗力，所以四营一连没有携带战车，全部乘马。辎重运输的马车还是带上了，又通过孙元化征调二十辆马车（也有牛车）。因为救助灾民，征召移民需要大批的粮食，山东正在闹饥荒，全部就地购买不现实。只能用船运到登州，再用马车运输到各地。有了朝鲜贸易得到的20万石稻米，朱万化也很有底气。他从威海紧急调运了500石粮食到登州，每辆马车装二十石粮食，由一连押运奔莱阳而去。这些粮食还不是很充足，如果仅供应粥食每人每天半斤粮，可供6000人吃一个月，后期还要设法购买、或者在输送一批。
朱万化带领四营一连先期到达莱阳县，这个连的连长叫朱全柱，就是在遵化接应赵率教立功的那个连长，并且被赵率教招为女婿，调到赵率教身边的事朱全柱没有答应。
巡抚孙元化派出随员跟随前往莱阳，以方便联络，为作战方便，经孙元化的同意，朱万化随即临时接管了莱阳的军政权力。
莱阳首要的工作是完善城防。登莱的卫所兵尚未来到，莱阳卫所兵临时只召集了几百人，朱万化用这些卫所兵和一个排的士兵混编，布防城墙城门，城门设岗盘查。命令县衙内的衙役出面，组织城里的士绅、商户组成临时的城内巡逻队，日夜不停的巡逻，防范闻香教的渗透、作乱活动。士绅商户非常踊跃，且认真负责，因为，如果乱民破城，他们将是第一批受害者。
然后派出连属特务班，配置一套气球通信设备，侦查各条道路。数十里的电报线路朱万化不敢使用，怕被破坏误事，只能使用光通信。要求特战士兵按照朱万化给出的地图侦查，侦查的重点是文登、莱阳间的乳山县西侧，那里有南北两条重要的通道，北面的通往莱阳，南面的通往灵山卫（就是后世的青岛）。
一天后特战士兵传回消息，乳山县已经被乱民占领。军情已经十分紧急。四营的另外两个连三天后才能到达，因此，这两个通道各派一个班临时驻守。朱万化手中一个连的兵力用去了一多半。
总算平安的度过了三天，四营绕道登州，用了四天时间全部到达莱阳，登州组织的卫所兵也开始陆续到达。朱万化总算放下紧张的心情，按步就班的安排道路布防、各地建立通信、组建俘虏看押营、在莱阳建移民营地、战役支援队等事务。
朱万化还从城里找了画师，用白布画了两丈高的人物画，三张一组，画了两组，连画师也不甚明白这个画的作用。
朱万化吩咐出征的明军、和战俘营准备大号的铁锅、炊具，应该是为俘虏准备的，并且吩咐，对俘虏可以打骂，但是不能打残废了，更不能随便杀人。
防御莱阳和各个路口，用去了一个连的兵力，平均一个道口只有一个班的士兵，重要道口配两个班，搭配50名卫所兵，他们带着大量旗帜的，用于虚张声势。这种布置完全基于快速通信设备的基础之上。一旦发现敌情，一个班有两支半自动机枪，一门52迫击炮（掷弹筒），六条左轮步枪，四把喷子，是能顶一阵子的。负责支援的一个连就会骑马迅速到达，支援时间定为最多一个时辰（两个小时）。另一个连是预备队。明军也分成两个支援队，步行支援，稍晚到达。为了快速支援守卫路口的士兵，支援营地和朱万化的指挥部移到莱阳以东60里处。
莱州城里立刻紧张起来，巡逻队日夜不停的巡查，禁止聚众聚会，各种教派是巡查的重点。有闻香教背景的一律抓捕审讯。城门设岗，进出都要盘查。
城中和附近大的乡镇都贴出告示，征召移民，告示前面都有人讲解。愿意移民台湾的，登记进入移民营，每天供两顿粥。到达台湾后，直到明年庄稼收获前，生活费、粮食由官府供给。农具、种子官府发放，由官府提供建筑材料村民自助修建住房。移民无偿分配土地，颁发土地证。收获庄稼后，开始征收农业税，按年征收，额度：按收成征收半成（百分之五）。
六月二十九日上午，乳山县城外传来消息，北侧通往莱阳的道路上，有数万乱民涌来，并且发生激烈的夺路战。朱万化带上朱全柱的一个连亲自前往前线，并且命令500卫所兵组成的支援队步行跟进，因为这种战斗有别于普通的两军对敌，除了军事，还掺杂了不少政治因素，朱万化要亲自观察掌握，取得经验，这种战斗今后还会有很多。
支援营地到达发生战斗的地点有六十多里，朱家的部队全部是龙骑兵（骑马行军，下马打仗），一小时内即可到达。
朱万化达到前线时战斗正在激烈进行，前线喊杀声一片，战壕里的两个班的士兵，正拼命射击阻拦。这里虽然是山地，但是，山都不高，也比较平缓。上万的乱民，也没有什么进攻的章法，只是漫山遍野地冲过来，正所谓，人一过万无边无沿，这气势也够吓人的。如果不是这两个班的火力猛，恐怕这会都挡不住了。后面的摇旗呐喊的50名卫所兵已经吓得没了声音，没有逃跑就不错了。
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