逃到库车的阿布都拉哈汗，一边派米尔咱.兴德去联络吉尔吉斯人，一边派怯皮克.米尔咱去接替伊卜喇伊木王子接收阿克苏的军队，他还派遣了亲信沙赫.巴兹伯克前往喀什噶尔，向叶尔羌汗提出了求和。
停驻于阿克苏的伊卜喇伊木王子接到了怯皮克.米尔咱传达的汗的命令后，并没有立刻向他交接兵马，而是邀请怯皮克.米尔咱在阿克苏先休息几日。
看着伊卜喇伊木王子身边那些对他虎视眈眈的部将们，怯皮克.米尔咱顿时汗流浃背了起来，对着伊卜喇伊木王子的吩咐点头称是，并不敢有所违抗。
怯皮克.米尔咱刚刚被带下去，伊卜喇伊木王子的部下们便纷纷出声反对接受阿布都拉哈汗的命令，认为王子留在阿克苏显然更为安全一些。
伊卜喇伊木王子遣散了身边部将，只留下了自己的老师兼顾问哈桑伯克。待到部下们离开房间后，隐藏在阴影中的伊卜喇伊木王子向着哈桑伯克问道：“我的阿塔利克，你认为我现在应该怎么做？”
比其他人知道更多内情的哈桑伯克，自然知道现在在阿克苏的可不只阿布都拉哈汗一方的使者。自从托克逊惨败的消息传开后，喀什噶尔和明人都派来了使者，希望伊卜喇伊木王子投向自己这一边。
哈桑伯克沉思了好一会，方才向着王子开口说道：“尊敬的王子殿下，就眼下的形势来看，汗要求你把军队交给怯皮克.米尔咱，然后让殿下前往库车，这并不是一件好事。
如果汗真的是需要军队保护自己的话，难道不是应该让殿下您带着军队前往库车吗？一只去掉了爪牙的狮子，又该怎么去保卫汗王呢？”
伊卜喇伊木王子摸着自己的下巴，悠悠的说道：“所以，阿塔利克你的意思是，汗打算对自己的兄弟下手吗？”
哈桑伯克沉默以对，似乎是默认了王子的猜测。伊卜喇伊木王子叹了口气，便改口向哈桑伯克另外问道：“那么现在，我应当怎么选择才好呢？”
哈桑伯克倒是很清楚王子询问的是什么选择，他侧着头思考了片刻后说道：“叶尔羌汗也不过是明人所扶植的傀儡，如果没有明人出兵的帮助，那么我们早就攻下喀什噶尔和叶尔羌，统一整个汗国了。
至于和明人、卫拉特部和叶尔羌汗的联盟顽抗到底，令东部可汗的血脉断绝，显然也不是明智的选择。
因此，臣以为接受明人使者提出的条件，是最优先的选择。毕竟明人离我们最远，他们需要我们的帮助，才能获得对于这片土地的统治权力…”
和阿克苏相距约800里的喀什噶尔城内，叶尔羌汗却没有想着借机北上收复阿克苏，而是把目标放在了此前一直拖他后腿的黑山派信徒及那些反对自己的叶尔羌伯克们身上。
叶尔羌汗召集了马守应等亲信和白山派的教士，提出了想要清算黑山派及叶尔羌伯克们的想法。虽然一些埃米尔们持有保留意见，但是白山派的教士和马守应都选择了支持他，这令叶尔羌汗顿时胆气大壮。
11月初，叶尔羌汗带着马守应、白山派教士，并从明军处借来了2500蒙古骑兵返回了叶尔羌城。
阿布都拉哈汗在托克逊惨败的消息已经传到了叶尔羌城，叶尔羌阿奇木米尔咱.哈齐.巴鲁刺思立刻转变了立场，带着一班埃米尔跑出城外30里去迎接了叶尔羌汗。
在叶尔羌汗的暗示下，米尔咱.哈齐.巴鲁刺思找出了一位和卓子弟站出来揭发了，遇袭失踪的和卓沙迪曾经同撒马尔罕的哈非孜.纳赛尔哈里发合谋，谋杀了米尔咱.马黑麻.玉苏普伯克和舒图尔哈里发、伊思玛业勒苏菲等一系列汗国的大人物的内幕。
接着这位子弟又控诉和卓沙迪的家族中，有人嫉妒和卓沙迪的权势，勾结了黑山派的一些教士，收买了马匪袭击了和卓沙迪和叶尔羌汗，试图一举除掉叶尔羌汗国的两个掌权者，为阿布都拉哈汗南下进军叶尔羌城做好准备。
这些人虽然暗杀了和卓沙迪，但是却不小心让克雷奇汗逃了出去，因此才没有取得全功。但是他们还是在之后对阿布都拉哈汗的叛乱中，为阿布都拉哈汗提供了许多帮助。
幸亏克雷奇汗得到了明国的帮助，才粉碎了这些奸细和阿布都拉哈汗的图谋。这位控诉者为了证明自己的话语是真实的，还指出了他偷听到的和卓沙迪的藏尸处。
叶尔羌汗听到了米尔咱.哈齐.巴鲁刺思的汇报之后，极为愤怒。他亲自指派了亲信伯克和米尔咱.哈齐.巴鲁刺思一起去寻找和卓沙迪的尸体，当和卓沙迪的尸体被送到叶尔羌城确认之后。
叶尔羌汗站在城内教堂前的大广场上召集了全城的居民，一是当众揭发了和卓沙迪同撒马尔罕勾结谋害贵族们的罪恶；一是痛斥了黑山派教士同那些伯克同党们的谋逆之举。
随即他要求叶尔羌城的伯克们当众举证和卓沙迪的罪行，并揭发那些谋害和卓的同党。这场批判和揭发整整持续了三日，那些不肯站出来揭发和批判的伯克们，很快被视为了和卓沙迪的同党，或是谋杀和卓沙迪的逆党，被叶尔羌汗抄没了家产并处以了极刑。
100多位伯克的脑袋被砍下之后，这场政治斗争便不可避免的向普通的商人和百姓深入下去了。白山派的教士们，刚开始还试图用经文来说服那些黑山派信徒改宗。
但是他们很快发现，用言辞来说服这些愚昧的信徒，倒不如用刀剑更为快捷。这场针对黑山派信徒的清洗，足足持续了近一个月，还是阿尔斯兰和孟乔芳看不下去，把部队从叶尔羌叫了回来，清洗才渐渐停息下来。
叶尔羌城的人口，因为这场清洗足足少了四分之一。而那些黑山派教士及叶尔羌伯克们的财富，则大多流入了叶尔羌汗及其亲信，还有明军手中。
这场屠杀虽然让叶尔羌汗掌握住了叶尔羌地区的权力，但是也令黑山派信徒及一些伯克们对于叶尔羌汗和白山派教士充满了仇恨，这些人或是逃亡到了撒马尔罕去，或是干脆投效了明军，以保全自己。
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